|
|
Proteomická analýza vybraných onkohematologických onemocnění
Pimková, Kristýna ; Dyr, Jan (vedoucí práce) ; Kodíček, Milan (oponent) ; Petrák, Jiří (oponent)
Oxidační stres je významným faktorem v karcinogenezi onkohematologických onemocnění, ovšem jeho role v patogenezi myelodysplastického syndromu (MDS) nebyla doposud objasněna. V této práci jsme stanovili oxidační status v plazmě MDS pacientů a sledovali změny proteomu (oxidační modifikace proteinů, interakce a vznik komplexů), ke kterým v plazmě MDS pacientů v důsledku oxidačního stresu dochází. Pomocí vysokoúčinné kapalinové chromatografie jsme stanovili hladiny celkového cysteinu, homocysteinu, cysteinylglycinu, glutathionu, dusitanů a dusičnanů v plazmě 61 MDS pacientů a 23 zdravých dárců. Oxidační stres u MDS pacientů prezentovaný signifikantně sníženými hladinami glutathionu a dusitanů a signifikantně zvýšenými hladinami ostatních aminothiolů nekoreloval s přetížením železem. Dále jsme naměřili zvýšené hladiny asymetrického dimethylargininu v séru pacientů středního věku s MDS, které souvisí s posttranslační modifikací arginylových zbytků proteinů. Nalezli jsme signifikantně zvýšenou hladinu karbonylovaných proteinů v plazmě MDS v porovnání se zdravými dárci. Pomocí hmotnostní spektrometrie jsme identifikovali pět S-nitrosylovaných proteinů krevních destiček u MDS pacientů a navrhli jsme soubor šestnácti plazmatických proteinů, z nichž některé mohou být s velkou pravděpodobností karbonylované v...
|
|
|
Characterization of ultra-thin polymer films on solid substrates using different physical techniques
Pop-Georgievski, Ognen ; Rypáček, František (vedoucí práce) ; Adam, Pavel (oponent) ; Werner, Carsten (oponent)
Cílem disertační práce je příprava ultratenkých polymerních filmů na pevných substrátech a jejich charakterizace pomocí fyzikálních metod. Fyzikální techniky, které jsou použity v této práci, selektivně popisují jednotlivé charakteristiky studovaných filmů. Některé z těchto technik jsou více specifické pro stanovení některých vlastností povrchů, avšak neposkytují informace o jiných důležitých vlastnostech těchto systémů. Proto pouze kombinací jednotlivých metod lze získat celkový pohled na architekturu, složení a funkci filmů a jejich vrstev. Tento kombinovaný přístup umožňuje získat hodnoty jednotlivých charakteristik a současně osvětluje fyzikální mechanizmy zodpovědné za chování zkoumaných systémů, což je důležité pro jejich další aplikace. Konkrétní polymerní filmy, jimiž se tato práce zabývá, reprezentují rozdílné typy systémů, které jsou významné pro aplikace v biomedicíně, biotechnologiích a tkáňovém inženýrství. Lze je zařadit do čtyř skupin: 1. Filmy polylaktidu vytvářené roubováním z tenkých filmů silanizovaného alakritu. 2. Polydopaminové filmy, které lze využít jako vhodnou platformu pro další modifikaci povrchů. 3. Polyethylenoxidové filmy roubované na povrchy potažené polydopaminem. 4. Poly(ω-methoxy-oligo(ethylene oxide) methacrylatovové), poly(ω-hydroxy-oligo(ethylene oxide)...
|
|
|
Characterization of Glutamate Carboxypeptidase II, its Close Homologs and their Interaction with Ligands
Tykvart, Jan
Nádorová onemocnění, skupina nemocí vyznačující se nekontrolovaným buněčným růstem, představuje jednu z velkých výzev moderního klinického výzkumu. V současnosti se standardní postup léčby spoléhá převážně na systémovou terapii, která využívá různé látky účinkující proti dělícím se buňkám, v kombinaci s chirurgickým odstraněním nádoru. Tento přístup je bohužel někdy doprovázen řadou nežádoucích vedlejších účinků (jako jsou například nevolnost, ztráta vlasů, neplodnost apod.) a navíc může docházet k opakovanému návratu nemoci. Z těchto důvodu se v posledních 40 letech investovalo mnoho prostředků a úsilí do nalezení způsobu jak ničit nádorové buňky více specificky. Nejběžnějším způsobem získání specifity se stalo hledání molekul (primárně proteinů), které by se vyskytovaly převážně v rakovinné a ne ve zdravé tkáni. Glutamátkarboxypeptidasa II (GCPII), známá též jako nádorový antigen specifický pro prostatu (PSMA), představuje jeden z takovýchto proteinů, jelikož je produkovaná ve velkém množství buňkami adenokarcinomu prostaty a navíc je přítomna v neovaskulaturách dalších pevných nádorů. GCPII se také často využívá jako modelová molekula při testování nových metod pro cílenou dopravu léčiv. Důkladná biochemická charakterizace GCPII je proto nezbytná pro její správné využití při výše zmíněných...
|
|
|
Solid-state Synthesis of Gold Nanoparticles on Dimpled Aluminum Surfaces and Their Transfer to Transparent Substrates
Lednický, Tomáš
In this work, it is proposed a novel and cost-effective fabrication method for forming gold nanoparticle films on transparent substrates. The method involves fabrication of templated aluminium substrate by porous-type anodic oxidation of aluminium foils. Furthermore, a thin gold layer is deposited over and subsequently annealed which results into the gold nanoparticles formation. Additionally, it is proposed a transfer onto transparent substrates such as PDMS or PMMA. The goal of this research is to build a localized surface plasmon resonance (LSPR) sensor element with a high performance and low fabrication costs.
|
|
| |
|
|
Characterization of Glutamate Carboxypeptidase II, its Close Homologs and their Interaction with Ligands
Tykvart, Jan
Nádorová onemocnění, skupina nemocí vyznačující se nekontrolovaným buněčným růstem, představuje jednu z velkých výzev moderního klinického výzkumu. V současnosti se standardní postup léčby spoléhá převážně na systémovou terapii, která využívá různé látky účinkující proti dělícím se buňkám, v kombinaci s chirurgickým odstraněním nádoru. Tento přístup je bohužel někdy doprovázen řadou nežádoucích vedlejších účinků (jako jsou například nevolnost, ztráta vlasů, neplodnost apod.) a navíc může docházet k opakovanému návratu nemoci. Z těchto důvodu se v posledních 40 letech investovalo mnoho prostředků a úsilí do nalezení způsobu jak ničit nádorové buňky více specificky. Nejběžnějším způsobem získání specifity se stalo hledání molekul (primárně proteinů), které by se vyskytovaly převážně v rakovinné a ne ve zdravé tkáni. Glutamátkarboxypeptidasa II (GCPII), známá též jako nádorový antigen specifický pro prostatu (PSMA), představuje jeden z takovýchto proteinů, jelikož je produkovaná ve velkém množství buňkami adenokarcinomu prostaty a navíc je přítomna v neovaskulaturách dalších pevných nádorů. GCPII se také často využívá jako modelová molekula při testování nových metod pro cílenou dopravu léčiv. Důkladná biochemická charakterizace GCPII je proto nezbytná pro její správné využití při výše zmíněných...
|
|
|
Characterization of Glutamate Carboxypeptidase II, its Close Homologs and their Interaction with Ligands
Tykvart, Jan ; Konvalinka, Jan (vedoucí práce) ; Obšil, Tomáš (oponent) ; Pavlíček, Jiří (oponent)
Nádorová onemocnění, skupina nemocí vyznačující se nekontrolovaným buněčným růstem, představuje jednu z velkých výzev moderního klinického výzkumu. V současnosti se standardní postup léčby spoléhá převážně na systémovou terapii, která využívá různé látky účinkující proti dělícím se buňkám, v kombinaci s chirurgickým odstraněním nádoru. Tento přístup je bohužel někdy doprovázen řadou nežádoucích vedlejších účinků (jako jsou například nevolnost, ztráta vlasů, neplodnost apod.) a navíc může docházet k opakovanému návratu nemoci. Z těchto důvodu se v posledních 40 letech investovalo mnoho prostředků a úsilí do nalezení způsobu jak ničit nádorové buňky více specificky. Nejběžnějším způsobem získání specifity se stalo hledání molekul (primárně proteinů), které by se vyskytovaly převážně v rakovinné a ne ve zdravé tkáni. Glutamátkarboxypeptidasa II (GCPII), známá též jako nádorový antigen specifický pro prostatu (PSMA), představuje jeden z takovýchto proteinů, jelikož je produkovaná ve velkém množství buňkami adenokarcinomu prostaty a navíc je přítomna v neovaskulaturách dalších pevných nádorů. GCPII se také často využívá jako modelová molekula při testování nových metod pro cílenou dopravu léčiv. Důkladná biochemická charakterizace GCPII je proto nezbytná pro její správné využití při výše zmíněných...
|
|
|
Proteomická analýza vybraných onkohematologických onemocnění
Pimková, Kristýna ; Dyr, Jan (vedoucí práce) ; Kodíček, Milan (oponent) ; Petrák, Jiří (oponent)
Oxidační stres je významným faktorem v karcinogenezi onkohematologických onemocnění, ovšem jeho role v patogenezi myelodysplastického syndromu (MDS) nebyla doposud objasněna. V této práci jsme stanovili oxidační status v plazmě MDS pacientů a sledovali změny proteomu (oxidační modifikace proteinů, interakce a vznik komplexů), ke kterým v plazmě MDS pacientů v důsledku oxidačního stresu dochází. Pomocí vysokoúčinné kapalinové chromatografie jsme stanovili hladiny celkového cysteinu, homocysteinu, cysteinylglycinu, glutathionu, dusitanů a dusičnanů v plazmě 61 MDS pacientů a 23 zdravých dárců. Oxidační stres u MDS pacientů prezentovaný signifikantně sníženými hladinami glutathionu a dusitanů a signifikantně zvýšenými hladinami ostatních aminothiolů nekoreloval s přetížením železem. Dále jsme naměřili zvýšené hladiny asymetrického dimethylargininu v séru pacientů středního věku s MDS, které souvisí s posttranslační modifikací arginylových zbytků proteinů. Nalezli jsme signifikantně zvýšenou hladinu karbonylovaných proteinů v plazmě MDS v porovnání se zdravými dárci. Pomocí hmotnostní spektrometrie jsme identifikovali pět S-nitrosylovaných proteinů krevních destiček u MDS pacientů a navrhli jsme soubor šestnácti plazmatických proteinů, z nichž některé mohou být s velkou pravděpodobností karbonylované v...
|
|
|
Characterization of ultra-thin polymer films on solid substrates using different physical techniques
Pop-Georgievski, Ognen ; Rypáček, František (vedoucí práce) ; Adam, Pavel (oponent) ; Werner, Carsten (oponent)
Cílem disertační práce je příprava ultratenkých polymerních filmů na pevných substrátech a jejich charakterizace pomocí fyzikálních metod. Fyzikální techniky, které jsou použity v této práci, selektivně popisují jednotlivé charakteristiky studovaných filmů. Některé z těchto technik jsou více specifické pro stanovení některých vlastností povrchů, avšak neposkytují informace o jiných důležitých vlastnostech těchto systémů. Proto pouze kombinací jednotlivých metod lze získat celkový pohled na architekturu, složení a funkci filmů a jejich vrstev. Tento kombinovaný přístup umožňuje získat hodnoty jednotlivých charakteristik a současně osvětluje fyzikální mechanizmy zodpovědné za chování zkoumaných systémů, což je důležité pro jejich další aplikace. Konkrétní polymerní filmy, jimiž se tato práce zabývá, reprezentují rozdílné typy systémů, které jsou významné pro aplikace v biomedicíně, biotechnologiích a tkáňovém inženýrství. Lze je zařadit do čtyř skupin: 1. Filmy polylaktidu vytvářené roubováním z tenkých filmů silanizovaného alakritu. 2. Polydopaminové filmy, které lze využít jako vhodnou platformu pro další modifikaci povrchů. 3. Polyethylenoxidové filmy roubované na povrchy potažené polydopaminem. 4. Poly(ω-methoxy-oligo(ethylene oxide) methacrylatovové), poly(ω-hydroxy-oligo(ethylene oxide)...
|
host ::
RSS.